Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM50Q86XT4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms