Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37DQ86XT2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms