Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP1Q86W92 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms