Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAPLN4Q86UW8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HAPLN4Q86UW8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms