Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KRT27Q7Z3Y8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT27Q7Z3Y8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms