Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP54Q7Z3B4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP54Q7Z3B4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms