Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SETXQ7Z333 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SETXQ7Z333 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms