Protein–RNA interactions for Protein: Q7L9B9

EEPD1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEPD1Q7L9B9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEPD1Q7L9B9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEPD1Q7L9B9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms