Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC80Q76M96 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms