Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2R2Q712K3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2R2Q712K3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2R2Q712K3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2R2Q712K3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms