Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BBS12Q6ZW61 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms