Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1R3FQ6ZSY5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms