Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1LQ6UX01 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMBR1LQ6UX01 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms