Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms