Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNT2Q6UVM3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms