Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC137Q6PK04 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC137Q6PK04 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms