Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF880Q6PDB4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms