Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLFN12LQ6IEE8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN12LQ6IEE8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms