Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms