Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
CARMIL2Q6F5E8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms