Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATL3Q6DD88 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL3Q6DD88 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms