Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPATA1Q5VX52 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms