Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms