Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDGFL1Q5TGJ6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDGFL1Q5TGJ6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms