Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEND3Q5T5X7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEND3Q5T5X7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms