Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NHSL1Q5SYE7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms