Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRMS1LQ5PSV4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms