Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms