Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLE1Q53GS7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms