Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSD17B12Q53GQ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms