Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZBED5Q49AG3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZBED5Q49AG3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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