Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00303Q3SY05 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00303Q3SY05 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms