Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LSM12Q3MHD2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSM12Q3MHD2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms