Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP41Q3LFD5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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