Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EDRF1Q3B7T1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDRF1Q3B7T1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms