Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TYSND1Q2T9J0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms