Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SWI5Q1ZZU3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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