Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HIST2H2BEQ16778 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HIST2H2BEQ16778 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HIST2H2BEQ16778 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HIST2H2BEQ16778 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HIST2H2BEQ16778 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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HIST2H2BEQ16778 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HIST2H2BEQ16778 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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HIST2H2BEQ16778 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST2H2BEQ16778 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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