Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIST3H3Q16695 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIST3H3Q16695 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms