Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms