Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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