Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC2Q16515 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms