Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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