Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA2Q15822 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA2Q15822 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms