Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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PTPAQ15257 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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PTPAQ15257 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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PTPAQ15257 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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PTPAQ15257 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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PTPAQ15257 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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PTPAQ15257 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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