Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRRQ15256 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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PTPRRQ15256 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRRQ15256 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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