Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDGFRLQ15198 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms