Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDK3Q15120 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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