Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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BRD3Q15059 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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BRD3Q15059 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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BRD3Q15059 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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BRD3Q15059 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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BRD3Q15059 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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BRD3Q15059 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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BRD3Q15059 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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BRD3Q15059 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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BRD3Q15059 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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