Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRAM2Q15035 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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